Метод МАЛДИ заключается в облучении короткими лазерными импульсами образца, представляющего собой твердый раствор анализируемого соединения в  органической матрице. Над поверхностью образца создается плотная высокотемпературная плазма, в которой наряду с молекулами и ионами матрицы оказываются и молекулы анализируемого соединения. Ионизация последних путем поглощения энергии фотонов или в  результате ионно-молекулярных реакций приводит к образованию положительных ([M+H]⁺, [M+Na]⁺) и отрицательных ([M-H]^—)  ионов, которые вытягиваются высоким потенциалом из области ионизации и направляются в анализатор. Метод характеризуется интенсивными пиками молекулярных ионов разного типа и низкой фрагментацией. К настоящему времени методом МАЛДИ успешно анализируются полипептиды, белки, нуклеотиды, полисахариды, синтетические полимеры, гуминовые кислоты, фуллерены, органические комплексные соединения и т. д. Данным методом доступны для анализа термолабильные, труднолетучие, высокомолекулярные соединения.

Оборудование: масс-спектрометр тандемный Ultraflex III TOF/TOF «Bruker», Германия